Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clip3B9EHT4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms