Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms