Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms