Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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