Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms