Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms