Protein–RNA interactions for Protein: B1B1D3

Zfp40, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp40B1B1D3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp40B1B1D3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms