Protein–RNA interactions for Protein: B1AZQ8

Cldn34b1, Claudin 34B1, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b1B1AZQ8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cldn34b1B1AZQ8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cldn34b1B1AZQ8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cldn34b1B1AZQ8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cldn34b1B1AZQ8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Cldn34b1B1AZQ8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Cldn34b1B1AZQ8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b1B1AZQ8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Cldn34b1B1AZQ8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Cldn34b1B1AZQ8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms