Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms