Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NhsB1AV60 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms