Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Trabd2bB1ATG9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Trabd2bB1ATG9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Trabd2bB1ATG9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Trabd2bB1ATG9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Trabd2bB1ATG9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Trabd2bB1ATG9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Trabd2bB1ATG9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trabd2bB1ATG9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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