Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms