Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm6880A3KG45 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm6880A3KG45 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm6880A3KG45 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm6880A3KG45 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm6880A3KG45 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm6880A3KG45 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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