Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Atp8b5A3FIN4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Atp8b5A3FIN4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Atp8b5A3FIN4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Atp8b5A3FIN4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Atp8b5A3FIN4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Atp8b5A3FIN4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Atp8b5A3FIN4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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