Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms