Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rnf39A2RT81 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rnf39A2RT81 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rnf39A2RT81 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rnf39A2RT81 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms