Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms