Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms