Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms