Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms