Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ambra1A2AH22 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ambra1A2AH22 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms