Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms