Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 384.5 ms