Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms