Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms