Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trav12-2A0N8N6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trav12-2A0N8N6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trav12-2A0N8N6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trav12-2A0N8N6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Trav12-2A0N8N6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Trav12-2A0N8N6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Trav12-2A0N8N6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Trav12-2A0N8N6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trav12-2A0N8N6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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