Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms