Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Scn2aA0A0J9YTW6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Scn2aA0A0J9YTW6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Scn2aA0A0J9YTW6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Scn2aA0A0J9YTW6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Scn2aA0A0J9YTW6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Scn2aA0A0J9YTW6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Scn2aA0A0J9YTW6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Scn2aA0A0J9YTW6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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