Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE3

Trbv15, T cell receptor beta, variable 15 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv15A0A0A6YYE3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Trbv15A0A0A6YYE3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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