Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5R5

Ighv4-1, Immunoglobulin heavy variable 4-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv4-1A0A075B5R5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv4-1A0A075B5R5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms