Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.06□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.03□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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TOP1MTQ969P6 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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TOP1MTQ969P6 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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TOP1MTQ969P6 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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TOP1MTQ969P6 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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TOP1MTQ969P6 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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