Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CPSF1Q10570 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CPSF1Q10570 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
CPSF1Q10570 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
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