Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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CLDN9O95484 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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CLDN9O95484 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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CLDN9O95484 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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CLDN9O95484 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
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CLDN9O95484 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
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CLDN9O95484 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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CLDN9O95484 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
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CLDN9O95484 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
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CLDN9O95484 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CLDN9O95484 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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