Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SP6Q3SY56 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SP6Q3SY56 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SP6Q3SY56 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SP6Q3SY56 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SP6Q3SY56 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SP6Q3SY56 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SP6Q3SY56 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SP6Q3SY56 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SP6Q3SY56 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SP6Q3SY56 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SP6Q3SY56 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SP6Q3SY56 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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