Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
SHROOM2Q13796 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130 ms