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Protein–RNA interactions for Protein: Q13620
CUL4B, Cullin-4B, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CUL4B
Q13620
RPS4XP11-201
ENST00000446897
772 nt
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
RNU6-295P-201
ENST00000516901
104 nt
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
CBX3P4-201
ENST00000538909
354 nt
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
AC008737.2-201
ENST00000599446
118 nt
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
LINC01790-201
ENST00000447194
2852 nt
TSL 2
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
ZGRF1-203
ENST00000445203
6529 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
RNU6-1123P-201
ENST00000362347
106 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
SNORA1B-201
ENST00000362535
133 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
Y_RNA.265-201
ENST00000364677
108 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
RNU6-806P-201
ENST00000365147
105 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
Y_RNA.418-201
ENST00000384029
102 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
RNU6-713P-201
ENST00000384761
107 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
TRAJ48-201
ENST00000390489
63 nt
APPRIS P1
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
MIR934-201
ENST00000401241
83 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
MIR1289-2-201
ENST00000408360
111 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
RPL21P38-201
ENST00000418090
167 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
CYCSP49-201
ENST00000420810
319 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
DYNLT3P2-201
ENST00000442517
295 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
PGBD4P5-201
ENST00000445958
426 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
snoU13.9-201
ENST00000458927
103 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
AL049830.1-201
ENST00000468034
425 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
AC098869.1-201
ENST00000481627
292 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
RNU6-1291P-201
ENST00000516591
104 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
RNU2-31P-201
ENST00000516954
155 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
AC007991.3-201
ENST00000517623
502 nt
TSL 4
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
AC136628.3-201
ENST00000521868
290 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
AP003097.2-201
ENST00000530126
178 nt
TSL 3
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
MIR3145-201
ENST00000580727
82 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
AC021506.2-201
ENST00000612354
169 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
AC008781.2-201
ENST00000502205
2480 nt
TSL 1 (best)
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
ASPN-202
ENST00000375544
2470 nt
APPRIS P1
TSL 1 (best)
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
RNU4-80P-201
ENST00000363200
141 nt
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
SNORA72-201
ENST00000384339
132 nt
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
MIR504-201
ENST00000385065
83 nt
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
MIR548F4-201
ENST00000408515
105 nt
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
RPL30P13-201
ENST00000418873
348 nt
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
AJ239322.2-201
ENST00000421696
575 nt
TSL 5
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
AC233266.1-201
ENST00000454518
96 nt
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
snoU13.15-201
ENST00000459407
104 nt
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
snoU13.26-201
ENST00000459452
105 nt
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
AC099513.1-201
ENST00000490423
301 nt
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
RNU6-191P-201
ENST00000516295
94 nt
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
AL117187.1-201
ENST00000555482
181 nt
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
AC136443.5-201
ENST00000603741
370 nt
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
AC242852.1-201
ENST00000612151
96 nt
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
AC073349.3-201
ENST00000617616
186 nt
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
AL513423.1-201
ENST00000621695
132 nt
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
AC244015.1-201
ENST00000622301
99 nt
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
SERPINI2-207
ENST00000476257
1837 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
Y_RNA.26-201
ENST00000362539
101 nt
BASIC
1.8
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
Y_RNA.84-201
ENST00000363011
104 nt
BASIC
1.8
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
RNU6-203P-201
ENST00000384038
104 nt
BASIC
1.8
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
Y_RNA.541-201
ENST00000384640
113 nt
BASIC
1.8
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
RNU6-997P-201
ENST00000384725
107 nt
BASIC
1.8
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
RN7SKP101-201
ENST00000411376
320 nt
BASIC
1.8
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
AC004965.1-201
ENST00000413033
213 nt
BASIC
1.8
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
STAG3L5P-204
ENST00000443759
179 nt
BASIC
1.8
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
SCARNA15.1-201
ENST00000516384
125 nt
BASIC
1.8
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
RNU6-635P-201
ENST00000516651
102 nt
BASIC
1.8
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
AC011604.1-201
ENST00000545978
196 nt
BASIC
1.8
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
AL360085.1-201
ENST00000604713
532 nt
BASIC
1.8
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
U6.104-201
ENST00000637979
90 nt
BASIC
1.8
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
MIR424-201
ENST00000362227
98 nt
BASIC
1.79
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
Y_RNA.162-201
ENST00000363683
102 nt
BASIC
1.79
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
Y_RNA.176-201
ENST00000363815
109 nt
BASIC
1.79
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
MIR215-201
ENST00000384858
110 nt
BASIC
1.79
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
RNU6ATAC19P-201
ENST00000408096
110 nt
BASIC
1.79
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
AL590705.2-201
ENST00000420204
281 nt
TSL 5
BASIC
1.79
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
MTCO1P5-201
ENST00000433573
344 nt
BASIC
1.79
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
AP003357.1-201
ENST00000604497
148 nt
BASIC
1.79
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
U91328.3-201
ENST00000608931
354 nt
TSL 3
BASIC
1.79
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
AC068647.2-201
ENST00000637380
353 nt
BASIC
1.79
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
SNORD33-201
ENST00000362761
85 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
RNU6-514P-201
ENST00000384208
107 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
Y_RNA.459-201
ENST00000384251
102 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
RNU6-1203P-201
ENST00000410703
110 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
LINC00428-201
ENST00000415620
227 nt
TSL 5
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
OR9P1P-201
ENST00000496431
281 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
RNU6-327P-201
ENST00000516270
127 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
RNU6-1045P-201
ENST00000516321
107 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
MIR4285-201
ENST00000581001
85 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
AL512605.2-201
ENST00000592972
256 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
TP73-AS1.1-201
ENST00000611447
161 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
AL078604.3-201
ENST00000615580
211 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
AC095038.3-201
ENST00000634439
195 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
KIAA1107-201
ENST00000370378
4622 nt
TSL 5
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
WWP1P1-201
ENST00000466609
2769 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
CUL4B
Q13620
SNORA25.1-201
ENST00000362326
128 nt
BASIC
1.77
□□□□□ -2.13
CUL4B
Q13620
Y_RNA.574-201
ENST00000384766
95 nt
BASIC
1.77
□□□□□ -2.13
CUL4B
Q13620
RNU6-1105P-201
ENST00000384774
107 nt
BASIC
1.77
□□□□□ -2.13
CUL4B
Q13620
SNORA12.1-201
ENST00000390873
148 nt
BASIC
1.77
□□□□□ -2.13
CUL4B
Q13620
MTATP8P1-201
ENST00000467115
207 nt
BASIC
1.77
□□□□□ -2.13
CUL4B
Q13620
RNU7-115P-201
ENST00000516433
55 nt
BASIC
1.77
□□□□□ -2.13
CUL4B
Q13620
AC015688.6-201
ENST00000577737
104 nt
BASIC
1.77
□□□□□ -2.13
CUL4B
Q13620
POLR3GP1-201
ENST00000594073
261 nt
BASIC
1.77
□□□□□ -2.13
CUL4B
Q13620
AC100781.1-201
ENST00000597142
383 nt
TSL 3
BASIC
1.77
□□□□□ -2.13
CUL4B
Q13620
MIR502-201
ENST00000606349
86 nt
BASIC
1.77
□□□□□ -2.13
CUL4B
Q13620
AC068733.3-201
ENST00000632757
269 nt
TSL 3
BASIC
1.77
□□□□□ -2.13
CUL4B
Q13620
ICE2P2-201
ENST00000483823
2787 nt
BASIC
1.77
□□□□□ -2.13
CUL4B
Q13620
LRRD1-203
ENST00000430130
2661 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
1.77
□□□□□ -2.13
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