Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TMED1Q13445 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TMED1Q13445 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TMED1Q13445 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TMED1Q13445 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TMED1Q13445 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TMED1Q13445 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TMED1Q13445 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
TMED1Q13445 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TMED1Q13445 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
TMED1Q13445 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TMED1Q13445 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TMED1Q13445 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
TMED1Q13445 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.6 ms