Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CBX3Q13185 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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