Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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GTF3C1Q12789 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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GTF3C1Q12789 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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