Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
LRRTM2O43300 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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