Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMPD4Q9NXE4 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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