Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RPUSD4Q96CM3 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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