Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SAMD1Q6SPF0 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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