Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GEN1Q17RS7 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GEN1Q17RS7 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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