Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-0.57□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.59□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
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