Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.8 ms