Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.61□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.59□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GPM6BQ13491 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
GPM6BQ13491 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GPM6BQ13491 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GPM6BQ13491 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GPM6BQ13491 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GPM6BQ13491 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GPM6BQ13491 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.4 ms