Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC-0.55□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
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TCOF1Q13428 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
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TCOF1Q13428 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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TCOF1Q13428 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
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TCOF1Q13428 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.5
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TCOF1Q13428 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.6□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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