Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms