Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERFP50548 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ERFP50548 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERFP50548 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERFP50548 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERFP50548 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERFP50548 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERFP50548 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERFP50548 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ERFP50548 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERFP50548 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERFP50548 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERFP50548 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERFP50548 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERFP50548 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERFP50548 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERFP50548 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERFP50548 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERFP50548 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ERFP50548 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ERFP50548 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ERFP50548 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ERFP50548 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ERFP50548 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ERFP50548 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ERFP50548 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ERFP50548 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ERFP50548 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ERFP50548 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ERFP50548 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ERFP50548 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ERFP50548 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ERFP50548 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ERFP50548 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ERFP50548 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ERFP50548 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ERFP50548 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ERFP50548 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ERFP50548 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ERFP50548 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERFP50548 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERFP50548 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERFP50548 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERFP50548 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERFP50548 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERFP50548 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERFP50548 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERFP50548 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERFP50548 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERFP50548 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERFP50548 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERFP50548 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERFP50548 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERFP50548 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERFP50548 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERFP50548 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERFP50548 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERFP50548 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERFP50548 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERFP50548 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ERFP50548 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
ERFP50548 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERFP50548 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERFP50548 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERFP50548 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERFP50548 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
ERFP50548 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERFP50548 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERFP50548 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERFP50548 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ERFP50548 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERFP50548 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERFP50548 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERFP50548 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERFP50548 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERFP50548 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERFP50548 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERFP50548 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERFP50548 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERFP50548 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERFP50548 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERFP50548 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERFP50548 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERFP50548 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERFP50548 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ERFP50548 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERFP50548 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERFP50548 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERFP50548 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERFP50548 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERFP50548 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERFP50548 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERFP50548 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERFP50548 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERFP50548 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ERFP50548 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ERFP50548 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ERFP50548 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ERFP50548 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ERFP50548 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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